Alfajayucan tiene un territorio conformado por lomeríos y un clima cálido. Posee múltiples presas y embalses de agua construidos para irrigar las tierras de cultivo de la región. En estos cuerpos de agua se produce mojarra, tilapia y carpa, y en ciertas temporadas las aves migratorias surcan el cielo para llegar ahí a reproducirse.

Se ubica en una comarca agrícola de regadío, habitada por pueblos otomíes que conjugan actividades como la cosecha de múltiples alimentos con labores artesanales. De su patrimonio cultural edificado, resalta el antiguo Convento de San Martín Obispo, obra franciscana del siglo XVI que en uno de sus altares tiene una imagen del Señor de la Buena Muerte, un Cristo crucificado alabado desde hace siglos por toda la población. Otra joya de este conjunto es la cruz atrial, escultura de piedra ubicada en el centro del patio del convento, que con diversos símbolos narra el origen del cristianismo.

La riqueza del patrimonio cultural inmaterial nos muestra artesanías, entre las que destaca el sombrero otomí, además de la fabricación de otros productos de palma tejida como los petates y la elaboración de ayates de ixtle. De sus fiestas tradicionales son atractivos los carnavales, con la presencia de los xitas o “viejitos”, personajes que se enfrentan en una guerra florida arrojándose naranjas. En su gastronomía hay desde tamales tradicionales, panes como los cocoles de ajonjolí, antojitos como los tlacoyos rellenos de frijol y los chicharrones de res, que son las vísceras fritas en un cazo con manteca.